截至2018年末，含山县共有卫生机构159个，其中医院（含民营医院）9个，乡镇卫生院8个，分院2个，社区卫生服务中心1个，妇幼保健院（所、站）1个，疾病预防控制中心1个，血防站1个，门诊部3个，厂（场）矿医务室1个，个体诊所34个；拥有卫生技术人员1362人，其中执业（助理）医师621人，注册护士663人。医院、卫生院共有床位1480张；村卫生室96个，乡村医生和卫生员226人，农村有医疗点的村占总村数的100%。
